Tugas 1 Pengantar Komputasi Modern

Judul Jurnal:
Anton, a Special-Purpose Machinefor Molecular Dynamics Simulation
Link Jurnal:
https://drive.google.com/file/d/0B6GUim_Q8keccW9PMWNkXzZSOG8/view

Isi Pembahasan Jurnal:
Jurnal tersebut membahas tentang masalah perhitungan dalam Dinamika Molekular dalam bidang Kimia dan obat-obatan khususnya. Permasalahan tersebut berupa reaksi kimia molekular yang dapat terjadi dalam waktu yang sangat cepat yaitu dalam rentang milidetik. Hal tersebut menyebabkan kesukaran bagi manusia dalam melakukan pengamatan dan penghitungan dengan cara konvensional yaitu dengan cara manual. Oleh karenanya permasalahan tersebut coba diselesaikan dengan cara mengembangkan sebuah alat komputasi Dinamika Molecular yang mampu melakukan pengamatan dan penghitungan reaksi kimia dalam skala milidetik.
Metode perhitungan Anton dalam MD mensimulasikan gerakan kumpulan atom (sistem kimia) selama periode waktu sesuai dengan hukum Waktu physics. Anton menggunakan metode k-ruang Gaussian perpecahan Ewald untuk mengurangi beban kerja komputasi yang terkait dengan interaksi elektrostatik. Metode ini membagi perhitungan gaya elektrostatik menjadi dua komponen. Pertama peluruhan cepat dengan pemisahan partikel dan dihitung langsung untuk semua pasangan partikel dipisahkan oleh kurangdari radius cutoff. Komponen kedua, interaksi jarak jauh, peluruhan yang lebih lambat, tetapi dapat dihitung secara efisien oleh biaya pemetaan dari partikel mesh biasa (biaya penyebaran), mengambil Fast Fourier Transform (FFT) dari biaya mesh, mengalikan dengan fungsi yang tepat dalam ruang Fourier, melakukan FFT terbalik, dan kemudian menghitung gaya pada partikel dari nilai-nilai mesh yang dihasilkan (gaya interpolasi).

Metode yang digunakan:
Metode perhitungan Anton dalam MD mensimulasikan gerakan kumpulan atom (sistem kimia) selama periode waktu sesuai dengan hukum Waktu physics. Anton menggunakan metode k-ruang Gaussian perpecahan Ewald untuk mengurangi beban kerja komputasi yang terkait dengan interaksi elektrostatik.

Kelebihan Metode:
  • Berinteraksi secara ketat ditambah menggunakan  jaringan komunikasi khusus berkecepatan tinggi
  • Secara dramatis mempercepat perhitungan yang mendominasi waktu yang dibutuhkan untuk simulasi MD
  • Penggunaan metode k-ruang Gaussian perpecahan Ewald mengurangi beban kerja komputasi yang terkait dengan interaksi elektrostatik
Kekurangan Metode:
  • Algoritma integrasi dan cara di mana masalah numerik yang ditangani dapat memiliki dampak yang signifikan terhadap akurasi
  • Beberapa simulasi memerlukan integrator untuk menghitung dan menyesuaikan variabel global seperti temperatur dan tekanan

Komentar

Posting Komentar

Postingan populer dari blog ini

Pengalaman Berbelanja melalui Website E-commerce

Seiring berkembangnya teknologi informasi dan komunikasi, semakin banyak kegiatan yang dapat kita lakukan dengan memanfaatkan teknologi tersebut. Dalam perkembangannya, kegiatan transaksi jual beli pada dunia maya menjadi sangat pesat. Transaksi bisnis pembelian dan penjualan produk apapun dapat kita temukan pada website-website e-commerce. Definisi E-Commerce sendiri menurut Laudon & Laudon (1998) adalah suatu proses membeli dan menjual produk-produk secara elektronik oleh konsumen dan dari perusahaan ke perusahaan dengan computer sebagai perantara transaksi bisnis. E-Commerce atau yang biasa disebut juga dengan istilah Ecom atau Emmerce atau EC merupakan pertukaran bisnis yang rutin dengan menggunakan transmisi Electronic Data Interchange (EDI), email, electronic bulletin boards, mesin faksimili, dan Electronic Funds Transfer yang berkenaan dengan transaksi-transaksi belanja di Internet shopping.   Manfaat dari digunakannya E-Commerce ini adalah dapat menekan biaya bara
Baca selengkapnya

Resensi Film Freaky Friday

Gambar
Judul Film    : Freaky Friday Tahun Rilis   : 2003 Genre            :  Keluarga, Fantasi, & Komedi Sutradara     :  Mark Waters Pemain          :  Lindsay Lohan, Jamie Lee Curtis, Mark Harmon, Harold Gould Sinopsis film Freaky Friday: Tess Coleman ( Jamie Lee Curtis ) adalah seorang terapis terkenal yang sangat sukses. Setelah suaminya meninggal, ia harus membesarkan kedua anaknya seorang sendiri. Semua itu dipersulit karena Anna ( Lindsay Lohan ) bukanlah tipe gadis remaja yang manis dan mudah diatur. Anna adalah tipe gadis pemberontak yang senang menghabiskan waktu bersama anggota band rocknya daripada belajar dan mengerjakan pekerjaan rumah. Pada suatu Kamis malam di sebuah restoran Cina, Tess dan Anna terlibat pertengkaran hebat yang membuat keduanya frustasi satu sama lain. Hal tersebut memicu pemilik restoran tersebut melakukan tindakan. Keduanya menerima kue keberuntungan (fortune cookies) yang diberikan si pemilik restoran. Setelah memakan kue
Baca selengkapnya

Makalah Aspek Keuangan: Komponen Biaya/ Anggaran

Gambar
BAB 1 PENDAHULUAN 1. 1    Latar Belakang Sebagai salah satu cara untuk mengendalikan perusahaan agar dapat mencapai sasaran, dunia usaha telah mengenal sistem pengendalian anggaran. Tidak ada satu perusahaan pun yang memiliki anggaran yang tidak terbatas, sehingga proses penyusunan anggaran menjadi hal penting dalam sebuah proses perencanan. Anggaran adalah suatu teknik yang dapat dipakai oleh manajemen di dalam menjalankan fungsinya di dalam perencanaan proses produksi, pengendalian biaya dan pengendalian laba. Setiap perusahaan pasti memiliki komponen biaya atau anggaran untuk menjalankan bisnis mereka sehingga bisnis yang mereka jalani dapat berjalan dengan lancar dan menghasilkan keuntungan yang besar. Dari keuntungan itu maka perusahaan dapat melakukan berbagai hal atau terobosan untuk para konsumen dan untuk keuntungan perusahaannya sendiri. 1.2     Rumusan Masalah Di dalam manajemen mengelola perusahaan pasti memerlukan rencana yang tidak menyimpang dari sasaran
Baca selengkapnya